Mặc dù cả MOC và MOF đều chứa các liên kết phối hợp hữu cơ-kim loại nhưng vẫn có những khác biệt cơ bản:
Kích thước: MOC là các phân tử rời rạc 0 chiều, trong khi MOF là mạng mở rộng vô hạn 2D hoặc 3D.
Độ hòa tan: Hầu hết các MOC đều hòa tan, trong khi MOF thường không hòa tan.
Tính ổn định: MOF thường có độ ổn định nhiệt cao hơn.
Trọng tâm ứng dụng: MOC vượt trội trong khả năng nhận dạng phân tử, trong khi MOF phù hợp hơn cho việc lưu trữ khí.